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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.
Data corrente:  07/01/2020
Data da última atualização:  23/01/2020
Tipo da produção científica:  Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Autoria:  SIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F.
Afiliação:  FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA.
Título:  CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2019.
Páginas:  34 p.
Série:  (Embrapa Gado de Corte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento , 45)
ISSN:  1983-9715
Idioma:  Português
Conteúdo:  Resumo - Variações no número de cópias de regiões específicas do DNA, ou simplesmente CNVs (Copy Number Variations), constituem um tipo de marcador molecular que é encontrado com frequência nos genomas de mamíferos e plantas. Em humanos, o impacto das CNVs sobre os fenótipos já foi relatado em características adaptativas, mortalidade embrionária e em algumas doenças complexas como autismo, esquizofrenia, doença de Chron, artrite reumatoide, diabetes tipo I e obesidade. Comparada aos SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), as CNVs envolvem um número maior de sequências genômicas, apresentando, potencialmente, um impacto mais pronunciado na expressão gênica, em função de alterações na estrutura e na dosagem gênica. Assim, acredita-se que esse marcador também exerça um papel importante na determinação de fenótipos de interesse em animais de produção, o que torna o mapeamento das CNVs e a sua utilização em estudos de associação genômica ampla (Genome-wide Association Studies - GWAS) ações extremamente importantes para prospecção de genes relacionados com características fenotípicas de interesse econômico. Neste contexto, equipes multidisciplinares envolvendo diferentes Unidades da Embrapa têm se dedicado a estudos envolvendo a identificação de CNVs, visando sua aplicação nos programas de melhoramento genético de bovinos de corte e leite.
Palavras-Chave:  Animais de produção; Candidate gene; Copy Number Variations; Farm animals; Gene candidato; Molecular marker; Structural variation; Variação estrutural.
Thesagro:  Bovino; DNA; Fenótipo; Gene; Genética Animal; Genoma; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Animal; Variação Genética.
Thesaurus Nal:  Genetic improvement; Genetic markers; Genome.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/209465/1/CNV-uma-ferramenta-promissora.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Corte (CNPGC)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGC17485 - 1UMTFL - DD
CNPTIA20380 - 1UPCFL - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F. Transcriptoma do carrapato dos bovinos. In: ANDREOTI, R.; GARCIA, M. V.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos na cadeia produtiva de bovinos. Brasília, DF: Embrapa, 2019. cap. 16, p. 205-222.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F. A tecnologia de microarranjos na identificação de genes de interesse na bovinocultura. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 35 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 111).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F. Phylogenetic of phylogeographic relations of Rhipicephalus microplus ( Acari: ixodidae) in Brazil. In: AMERICAN ASSOCIATION OF VETERINARY PARASITOLOGISTS ANNUAL MEETING, 60.; LIVESTOCK INSECT WORKERS CON-FERENCE, 59.; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ECTOPARASITES OF PETS, 13.,2015, Boston, MA. Parasitic Evolution Scientific Revolu-tion: Proceedings... Boston, MA: American Association of Veterinary Parasitologists, 2015. Resumo 146. 1 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F. CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2019. 34 p. (Embrapa Gado de Corte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento , 45)
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.
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5.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformática aplicada à agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 4. p. 67-83.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformatics applied to agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 4, p. 67-86.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H. BOS_ANNOTATION: Pipeline baseado em bancos de dados públicos para associação e anotação automática de transcriptomas bovinos. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F. Conceitos estatísticos aplicados à experimentação zootécnica. PUBVET, Londrina, v. 8, n. 12, art. 1734, jun. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K.; GIACHETTO, P. F. Conceitos estatísticos aplicados à experimentação zootécnica. PUBVET, Londrina v. 8, n. 12, art. 1734, jun. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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10.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Multilab bioinformática: laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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11.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; OKURA, V. K. Código na linguagem estatística R que automatiza o processo de construção e análise de redes gênicas para dados de microarranjos da plataforma Affymetrix, utilizando a metodologia WGCNA. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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12.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; GONÇALVES, A. R. CNP_ID: um pipeline para identificação das CNVs mais frequentes na população (CNPs, de Copy Number Polymorphisms), por meio da ferramenta CNstream. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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13.Imagem marcado/desmarcadoGOZZO, V. C.; GIACHETTO, P. F. Utilização da metodologia WGCNA na construção de redes gênicas e identificação de mecanismos envolvidos na resposta de vacas à mastite. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 76-79.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSALMAN, A. K. D.; GIACHETTO, P. F. Identificação de polimorfismos no gene da leptina bovina. Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2008. 9 p. (Embrapa Rondônia. Comunicado Técnico, 336).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoGONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F. Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de gentipagem de SNPs com chips de alta densidade. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 183-186.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCSORDA, B. G.; GIACHETTO, P. F.; ANDREOTTI, R. Protocolos para estudos de variabilidade genética em populações de carrapatos. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos: protocolos e técnicas para estudo. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 143-153
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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17.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F.; CUNHA, R. C. Advances in tick vaccinology in Brazil: from gene expression to immunoprotection. Frontiers in Bioscience - Scholar, v. 10, n. 1, p. 127-142, Jan. 2018
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.
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18.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F. Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 179-182.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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19.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. de P. CNV_ID: um pipeline para detecção e análise de variações no número de cópias do genoma (CNVs) utilizando a ferramenta PennCNV. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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20.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Utilização da plataforma Galaxy na análise de dados de RNAseq. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 175-178.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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